本辦法修正重點如下：

1. 刪除育嬰留職停薪僅得以本人或配偶之一方申請為限之規定；將照顧三足歲以下孫子女納入得申請留職停薪情事；調整申請依親留職停薪之條件；另放寬國外醫療機構出具之證明文件亦得作為認定重大傷病之依據。（修正條文第四條）
2. 修正留職停薪教師於寒、暑假復職，有不可預期之緊急情事，始得以同一事由申請於次學期開學後留職停薪，及其認定有疑義時之處理程序。（修正條文第五條）
3. 修正提前復職或延長留職停薪者，應有不可預期之緊急情事，及其認定有疑義時之處理程序。（修正條文第六條）
4. 分款明訂教師、社會教育機構專業人員或學術研究機構研究人員、運動教練三類教育人員，其等留職停薪期間所遺職（課）務之處理方式。（修正條文第九條）
5. 增訂留職停薪教師於寒、暑假復職，又因同一事由申請於次學期開學後留職停薪、留職停薪期間屆滿前原因消滅提前復職，或留職停薪期間屆滿延長留職停薪時，其申請案件處理程序之規定。（修正條文第十一條）